Pendidikan di Muhammadiyah bertujuan untuk menyiapkan lingkungan yang memupuk kesadaran akan kehadiran ALLAH SWT sebagi Rabb dan juga dapat menguasai ilmu pengetahuan seni dan teknologi. Salah satu Peran Kyai dalam mengubah tata laku masyarakat terdahulu antara lain meluruskan tata laku penguasa dalam ritual. Mereka mengajak masyarakat memahami agama islam seutuhnya. Tidak hanya memurnikan ajaran islam, membangun musholla, mengajak warga kampung untuk sholat berjamaah adalah peran penting Muhammadiyah dalam mendidik masyarakat memahami ilmu agama secara menyeluruh.

“Kyai Ahmad Dahlan sendiri juga  berpesan bahwa dalam mendidik dan menyebarkan ilmu pengetahuan dan agama tidak hanya cukup dengan memahami namun juga harus “nglakoni” atau mempraktekkan,”

Tidak hanya fokus dalam kegiatan organisasi keagamaan semata namun Muhammadiyah sejak ratusan tahun yang lalu mempunyai kontribusi yang cukup banyak dalam dunia pendidikan di Indonesia, meski banyak yang belum menyadari hal tersebut.

Maka dari itu Tujuan Madrasah Ibtidaiyah Muhammdiyah Kramat Mulur mempersiapkan sedini mungkin generasi penerus bangsa yang berkualitas dengan membantu dan memberikan Pendidikan yang berkualitas untuk mengembangkan berbagai potensi yang dimiliki anak didik baik psikis dan fisik yang meliputi moral dan nilai-nilai agama, sosial emosional, kognitif, Bahasa, fisik / motoric, kemandirian dan seni untuk siap memasuki Pendidikan dasar .